Kehidupan biota laut, baik tumbuh-tumbuhan, hewan maupun mikroba, dimana pun ia terdapat selalu dipengaruhi oleh faktor-faktor lingkungan.
Adapun beberapa faktor ekologis yang mempengaruhi kehidupan alga seperti keadaan substrat dasar perairan, cahaya, suhu, salinitas, kekeringan, nutrien dan gerakan air.
Tiap spesies alga memiliki toleransi yang berbeda-beda terhadap faktor-faktor ekologis tersebut. Faktor-faktor tersebut dapat berpengaruh bersama-sama dan sederajat, atau satu faktor lebih menonjol pengaruhnya daripada faktor yang lain.
Seperti pada muara sungai, faktor salinitas lebih menonjol pengaruhnya daripada faktor-faktor lain dalam kaitannya dengan sebaran biota dari sungai ke laut dan sebaliknya.
